Los proyectos de resolución del ministro Eduardo Medina Mora fueron objeto de polémica en distintos sectores, entre los que destacan, pretender que la Fiscalía General de la República pudiera intervenir cuentas bancarias sin una orden judicial y avalar la devolución del IVA a accionistas del Grupo Modelo, sin encontrar eco en la postura de sus compañeros.
El abogado propuso amparar a Beatriz Sánchez Navarro Redo, exaccionista del Grupo Modelo, quien pedía la devolución de 47.7 millones de pesos por concepto de impuestos correspondientes al 2013.
Sin embargo, la mayoría de los integrantes de la sala rechazaron la argumentación jurídica.
Medina Mora también impulsó un proyecto para amparar a Telmex a fin de que a partir de este año cobre tarifas de interconexión a sus competidoras, las cuales serán determinadas por el Instituto Federal de Telecomunicaciones (IFT).